ساختار سازمان عبارت است از:
۱ ستاد مرکزی سازمان که در تهران مستقر است.
۲ مرکز تربیت مربی فنی و حرفه ای
۳ ادارات کل آموزش فنی و حرفهای استانها
۴ مراکز آموزش فنی و حرفهای
۵ - مراکز سنجش مهارت و تعیین صلاحیت حرفهای
۱ ستاد مرکزی سازمان که در تهران مستقر است.
۲ مرکز تربیت مربی فنی و حرفه ای
۳ ادارات کل آموزش فنی و حرفهای استانها
۴ مراکز آموزش فنی و حرفهای
۵ - مراکز سنجش مهارت و تعیین صلاحیت حرفهای
تبصره ۱:سازمان مجاز است مراکز آموزش و سنجش مهارت خیّرساز را با رعایت موازین شرعی و مقتضای وقف، وصیت یا عناوین مشابه آن و همچنین مراکز دولتی را بر اساس شاخص های آموزش فنی و حرفه ای، نیروی انسانی، فضا و تجهیزات و اداری و مالی رتبه بندی و به صورت هیأت امنائی اداره و بر آنها نظارت نماید. اعضای هیأت امنا که توسط رئیس سازمان، تعیین و منصوب می شوند عبارتند از:
۱ رئیس مرکز
۲ یک نفر از مربیان مرکز
۳ یک نفر از اتاق بازرگانی شهرستان ذیربط
۴ یک نفر از اتاق اصناف شهرستان ذیربط
۵ - یک نفر خبره آموزش های فنی و حرفه ای
۶ - دو نفر از خیّرین (در مراکز خیّرساز)
تدوین و تصویب برنامه و بودجه سالانه، نظارت بر هزینه کردها و تصویب صورت های مالی، تعیین حسابرس و خزانه دار و جذب و قبول کمک اشخاص حقیقی و حقوقی در چهارچوب قوانین و مقررات از وظایف هیات امناء می باشد. تصمیمات هیات امناء بعد از تأیید مدیرکل آموزش فنی و حرفه ای استان ذیربط، لازم الاجر است.
۱ رئیس مرکز
۲ یک نفر از مربیان مرکز
۳ یک نفر از اتاق بازرگانی شهرستان ذیربط
۴ یک نفر از اتاق اصناف شهرستان ذیربط
۵ - یک نفر خبره آموزش های فنی و حرفه ای
۶ - دو نفر از خیّرین (در مراکز خیّرساز)
تدوین و تصویب برنامه و بودجه سالانه، نظارت بر هزینه کردها و تصویب صورت های مالی، تعیین حسابرس و خزانه دار و جذب و قبول کمک اشخاص حقیقی و حقوقی در چهارچوب قوانین و مقررات از وظایف هیات امناء می باشد. تصمیمات هیات امناء بعد از تأیید مدیرکل آموزش فنی و حرفه ای استان ذیربط، لازم الاجر است.